Forschungsdaten – Titel und Zusammenfassungen von Publikationen, extrahierte Daten und Katalogeinträge – erscheinen in ihrer Originalsprache Englisch.
Electrogen · Iron reducer · Manganese reducer
Shewanella oneidensis MR-4
Auch bekannt als S. oneidensis MR-4
Pseudomonadota · Gammaproteobacteria · Shewanellaceae
- Shewanella
- Electrogen
- Marine
- Tier 2
01 · Identität
Identität
Wo dieser Organismus im Stammbaum des Lebens steht, wie man ihn bezieht und wie eine Zelle aussieht.
Abstammungslinie
- DomäneBacteria
- ›PhylumPseudomonadota
- ›KlasseGammaproteobacteria
- ›OrdnungAlteromonadales
- ›FamilieShewanellaceae
- ›GattungShewanella
- ›ArtShewanella oneidensis MR-4
Stammsammlungen & Zugangsnummern
- NCBI-Taxon
- 60480
Zellmorphologie
Rod, Gram-negative (diderm)
- Beweglich: ja
02 · Elektronentransfer
Elektronentransfer
Wie Elektronen die Zellhülle überwinden – die Eigenschaft, die einen Mikroorganismus in einem elektrochemischen System nützlich macht.
Mechanismen
- Außenmembran-Cytochrome: ja
- Endogene Shuttles: ja
Direkter Transfer – Details
- Notes
- Mtr pathway (MtrCAB, OmcA) homologous to MR-1; performance and shuttle production slightly different.
- Completeness
- Mapped
Vermittelter Transfer – Details
- Completeness
- Mapped
03 · Wachstumsbereich
Wachstumsbereich
Die Bedingungen, die dieser Organismus toleriert, wovon er sich ernährt und was er veratmet – das Betriebsfenster für einen Reaktor.
Energiestoffwechsel
Elektronendonatoren
- Lactate
- H2
- Formate
Elektronenakzeptoren
- O2
- Fe(III)
- Mn(IV)
- Anode
- Dmso
- Tmao
Kohlenstoffquellen
- Lactate
- Formate
- Respiratorisch: ja
04 · Wachstums- & Elektronentransferkinetik
Wachstums- & Elektronentransferkinetik
Wie schnell dieser Organismus wächst und wie stark er Elektronen an eine Anode abgibt, wie das Korpus es berichtet, und was diese Konstanten ergeben, wenn man sie rechnet.
Kinetische Belege
| Parameter | Median | 10–90 % | n | Quelle |
|---|---|---|---|---|
| Max. spezifische Wachstumsrate μmax | 0,014 h⁻¹ | — | 1 | 1 Publikation |
| Halbsättigungskonstante Ks | 124 mg/L | — | 1 | 1 Publikation |
| Biomasseausbeute Y | 0,1 g/g | 0,05–0,18 | 3 | Gattungs-Prior · 3 Quellen |
| Absterbekoeffizient kd | Noch nicht im Korpus | |||
| Austauschstromdichte i₀ | Noch nicht im Korpus | |||
| Durchtrittsfaktor α | Noch nicht im Korpus | |||
| Tafel-Steigung | Noch nicht im Korpus | |||
Median der extrahierten Werte, die 10–90-%-Streuung dahinter und wie viele Werte er bündelt.
1 Zeilen wurden nicht gebündelt: ihre Einheit ließ sich nicht eindeutig umrechnen.
Belegzeilen (3)
- Max. spezifische Wachstumsrate μmax0,014 h⁻¹Nicht geprüftArtzeileKonfidenz 1
Metabolic Characteristics of a Glucose-Utilizing Shewanella oneidensis Strain Grown under Electrode-Respiring Conditions · 2015 · 10.1371/journal.pone.0138813
“This difference in the current densities may reflect a difference in the growth rates of this strain in GMM and LMM (0.014 h⁻¹ and 0.35 h⁻¹, respectively, under fumarate-reducing conditions).”
- Halbsättigungskonstante Ks124 mg/LNicht geprüftArtzeileKonfidenz 1
Performance of a Batch Operation Microbial Fuel Cell (MFC) with Cobalt Micronutrient Addition Based on Kinetic Models · 2024 · 10.9767/bcrec.20259
“Utami reported that MFCs with tempeh waste substrate produced a kinetic parameter value Ks of 124 mg/L with a power density of 0.033 mW/m² [10].”
Aufgelistet, nicht gebündelt (1)
- Max. spezifische Wachstumsrate μmax0,35 h⁻¹Nicht geprüftArtzeileKonfidenz 1
Metabolic Characteristics of a Glucose-Utilizing Shewanella oneidensis Strain Grown under Electrode-Respiring Conditions · 2015 · 10.1371/journal.pone.0138813
“This difference in the current densities may reflect a difference in the growth rates of this strain in GMM and LMM (0.014 h⁻¹ and 0.35 h⁻¹, respectively, under fumarate-reducing conditions).”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · substrate: lactate; the pooled substrate is glucose
Prior auf Gattungsebene: Shewanella oneidensis
Ein Prior auf Gattungsebene fasst die ganze Gattung zusammen; er ist keine Messung an diesem Stamm.
Konstanten, die die Simulation antreiben
Szenario – Ihre Werte, keine Belege
Zu wenige Belege für eine Simulation
Für diesen Organismus gibt es im Korpus noch kein Biomasseausbeute Y.
- Biomasseausbeute Y
2 verknüpfte Publikationen berichten kinetische Konstanten; die Extraktion steht aus. Zu seinen Publikationen
Diese Kurven sind eine Monod- und Nernst-Monod-Idealisierung (nach Marcus et al. 2007 und Torres et al. 2008), parametrisiert allein durch die oben aufgeführten Konstanten: jede trägt ihr n und ihren 10–90-%-Bereich, und eine Konstante mit n = 1 hat gar keine Streuung. Keine Diffusion im Biofilm, keine Ablösung, keine Aufteilung nach coulombscher Effizienz. Die Szenariowerte sind Ihre, keine Belege.
05 · Leistung
Leistung
Berichtete elektrochemische Leistung, die Rolle im Reaktor und was der Organismus produziert.
Rolle im Reaktor
06 · Ökologie & Biofilm
Ökologie & Biofilm
Wie der Organismus auf einer Elektrode lebt, mit welchen Partnern er kooperiert und wo er in der Natur vorkommt.
Ökosysteme
- Marine
- Sediment marine
07 · Anwendungen, Stammentwicklung & Sicherheit
Anwendungen, Stammentwicklung & Sicherheit
Wo der Organismus bereits eingesetzt wurde, wie gut er sich gentechnisch verändern lässt und welche Handhabung er erfordert.
Anwendungen (1)
- Bioelectricity generationTRL 3/9
Biologische Sicherheit
- Pathogen: nein
08 · Quellen & Datenqualität
Quellen & Datenqualität
Jeder Wert oben lässt sich auf eine Quelle zurückführen. So vollständig und so belastbar ist der Datensatz.
Qualität des Datensatzes
Literaturstand 2026-05-13 · Schema v1.3.0 · aktualisiert 2026-05-13 · importiert 2026-05-13
Offene Datenlücken (1)
- MR-4-specific electrochemical performance is rarely separated from MR-1 in the corpus.
Referenzen (1)
- Bretschger O, et al. (2007). Current production and metal oxide reduction by Shewanella oneidensis MR-1 wild type and mutants. Appl Environ Microbiol 73:7003-7012. (Comparative paper that brackets MR-1 vs MR-4 performance.)doi:10.1128/AEM.01087-07