Forschungsdaten – Titel und Zusammenfassungen von Publikationen, extrahierte Daten und Katalogeinträge – erscheinen in ihrer Originalsprache Englisch.
Electrogen · DIET partner donor · Iron reducer
Geobacter metallireducens GS-15
Thermodesulfobacteriota · Desulfuromonadia · Geobacteraceae
- Aromatic degrader
- Uranium bioremediation
- Tier 1
- DIET donor
01 · Identität
Identität
Wo dieser Organismus im Stammbaum des Lebens steht, wie man ihn bezieht und wie eine Zelle aussieht.
Abstammungslinie
- DomäneBacteria
- ›PhylumThermodesulfobacteriota
- ›KlasseDesulfuromonadia
- ›OrdnungGeobacterales
- ›FamilieGeobacteraceae
- ›GattungGeobacter
- ›ArtGeobacter metallireducens GS-15
Früher klassifiziert als Deltaproteobacteria.
Stammsammlungen & Zugangsnummern
- DSMZ
- DSM 7210
- ATCC
- ATCC 53774
- NCBI-Taxon
- 269799
- Genom
- GCF_000012585.1
- Status
- Typstamm
Isolierung
Isoliert aus Potomac River sediment, Maryland, USA von Lovley DR, Phillips EJP (1987).
Lovley DR, Phillips EJP (1988). Manganese inhibition of microbial iron reduction in anaerobic sediments.
Genom
Zellmorphologie
Rod, Gram-negative (diderm)
- Beweglich: ja
- Pili: ja
- Vesikel der äußeren Membran: nein
- Sporenbildend: nein
02 · Elektronentransfer
Elektronentransfer
Wie Elektronen die Zellhülle überwinden – die Eigenschaft, die einen Mikroorganismus in einem elektrochemischen System nützlich macht.
Mechanismen
- Außenmembran-Cytochrome: ja
- Leitfähige Pili / Nanodrähte: ja
03 · Wachstumsbereich
Wachstumsbereich
Die Bedingungen, die dieser Organismus toleriert, wovon er sich ernährt und was er veratmet – das Betriebsfenster für einen Reaktor.
Energiestoffwechsel
Elektronendonatoren
- Acetate
- Ethanol
- aromatic compounds
Elektronenakzeptoren
- Fe(III)
- Mn(IV)
- U(VI)
- Anode
- Nitrate
Kohlenstoffquellen
- Acetate
- Ethanol
- Benzoate
- Toluene
- Phenol
- p-cresol
- Butyrate
- Propionate
- Respiratorisch: ja
- Fermentativ: nein
Stoffwechsel – Details
- ATP synthase type
- Proton dependent
- Energy conservation mechanism
- Oxidative phosphorylation
04 · Wachstums- & Elektronentransferkinetik
Wachstums- & Elektronentransferkinetik
Wie schnell dieser Organismus wächst und wie stark er Elektronen an eine Anode abgibt, wie das Korpus es berichtet, und was diese Konstanten ergeben, wenn man sie rechnet.
Kinetische Belege
| Parameter | Median | 10–90 % | n | Quelle |
|---|---|---|---|---|
| Max. spezifische Wachstumsrate μmax | 0,06 h⁻¹ | 0,03–0,12 | 3 | Gattungs-Prior · 2 Quellen |
| Halbsättigungskonstante Ks | 90 mg/L | 20–200 | 2 | Gattungs-Prior · 2 Quellen |
| Biomasseausbeute Y | 0,07 g/g | 0,04–0,1 | 2 | Gattungs-Prior · 2 Quellen |
| Absterbekoeffizient kd | Noch nicht im Korpus | |||
| Austauschstromdichte i₀ | Noch nicht im Korpus | |||
| Durchtrittsfaktor α | Noch nicht im Korpus | |||
| Tafel-Steigung | Noch nicht im Korpus | |||
Median der extrahierten Werte, die 10–90-%-Streuung dahinter und wie viele Werte er bündelt.
36 Zeilen wurden nicht gebündelt: ihre Einheit ließ sich nicht eindeutig umrechnen.
Belegzeilen (36)
Aufgelistet, nicht gebündelt (36)
- K_M0,35 mMNicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,93
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM = 0.28-0.42 mM (2nd cycle) || range: [0.28, 0.42] || canonical_organism: geobacter_sulfurreducens_pca || canonical_substrate: acetate”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,35 mMNicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,93
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM = 0.28-0.42 mM (2nd cycle) || range: [0.28, 0.42] || canonical_organism: geobacter_sulfurreducens_pca || canonical_substrate: acetate”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- vmax0,0034 mmol/h/cm²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,92
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax = 0.0031-0.0037 mmol h⁻¹ cm⁻² (2nd cycle) || range: [0.0031, 0.0037] || canonical_organism: geobacter_sulfurreducens_pca || canonical_substrate: acetate”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0034 mmol/h/cm²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,92
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax = 0.0031-0.0037 mmol h⁻¹ cm⁻² (2nd cycle) || range: [0.0031, 0.0037] || canonical_organism: geobacter_sulfurreducens_pca || canonical_substrate: acetate”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0042 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0051 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0031 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0037 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- K_M1,02 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M2,61 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,28 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,42 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- vmax0,0042 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0051 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0031 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0037 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- K_M1,02 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M2,61 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,28 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,42 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- vmax0,0042 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0051 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0031 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0037 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- K_M1,02 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M2,61 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,28 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,42 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- vmax0,0042 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0051 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0031 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- vmax0,0037 mmol Ac⁻ h⁻¹ cm⁻²Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“vmax,Ac and KM,Ac, decreased from 0.0042–0.0051 mmol Ac−h−1 cm−2 to 0.0031–0.0037 mmol Ac−h−1 cm−2”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · unrecognised kinetic parameter "vmax"
- K_M1,02 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M2,61 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,28 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
- K_M0,42 mM Ac⁻Nicht geprüftGattungszeileKonfidenz 0,9
Determining incremental coulombic efficiency and physiological parameters of early stage Geobacter spp. enrichment biofilms · 2020 · 10.1371/journal.pone.0234077
“KM,Ac, decreased from 1.02–2.61 mM Ac− to 0.28–0.42 mM Ac−”
Nicht in eine Schätzung eingegangen · Michaelis-Menten Km, not Monod Ks
Prior auf Gattungsebene: Geobacter metallireducens
Ein Prior auf Gattungsebene fasst die ganze Gattung zusammen; er ist keine Messung an diesem Stamm.
Konstanten, die die Simulation antreiben
Szenario – Ihre Werte, keine Belege
Wachstumssimulation
Szenario: Anfangssubstrat 1.000 mg/L · Anfängliche anhaftende Biomasse 0,1 g/m² · Anodenfläche je Flüssigkeitsvolumen 100 m²/m³ · Dauer 72 h · Satzbetrieb. Ihre Werte, keine Belege.
Kein Strommodell
Der Strom braucht Max. Stromdichte jmax, Halbsättigungspotenzial E_KA; diese Quelle hat sie nicht.
- Substratgesättigtes Wachstum
- Verlangsamung
- Stationär
Monod-Wachstum kennt keine Lag-Phase; die Bänder markieren, wo die Nettowachstumsrate nahe ihrem Maximum liegt, fällt, nahe null oder negativ ist.
Hinweise des Simulators
- decayPerH absent: no endogenous decay term, so growth is an upper bound
- biofilmDensityKgPerM3 absent: thickness not computed (thicknessUm = null)
- no anodePotentialVvsShe / overpotentialV given: current not computed (currentDensityAPerM2 = null)
Diese Kurven sind eine Monod- und Nernst-Monod-Idealisierung (nach Marcus et al. 2007 und Torres et al. 2008), parametrisiert allein durch die oben aufgeführten Konstanten: jede trägt ihr n und ihren 10–90-%-Bereich, und eine Konstante mit n = 1 hat gar keine Streuung. Keine Diffusion im Biofilm, keine Ablösung, keine Aufteilung nach coulombscher Effizienz. Die Szenariowerte sind Ihre, keine Belege.
05 · Leistung
Leistung
Berichtete elektrochemische Leistung, die Rolle im Reaktor und was der Organismus produziert.
Rolle im Reaktor
06 · Ökologie & Biofilm
Ökologie & Biofilm
Wie der Organismus auf einer Elektrode lebt, mit welchen Partnern er kooperiert und wo er in der Natur vorkommt.
Biofilm
- Bildet Biofilm: ja
Bevorzugte Elektrodenmaterialien
- Graphite
- carbon cloth
Partner im Elektronenaustausch (2)
- gibt e⁻ ab an →Methanosarcina acetivorans
ethanol-fed methanogenic coculture
Co culture demonstrated - gibt e⁻ ab an →Methanothrix harundinacea
ethanol→methane stoichiometric conversion
Co culture demonstrated
Vermittlung über leitfähige Minerale
- Vermittelt über leitfähige Minerale: ja
- Magnetite
Magnetite-stimulated DIET with Methanothrix harundinacea (Liu 2015).
Ökosysteme
- Freshwater
- Subsurface
- Rice paddy
Isolierungsquellen
- freshwater sediment, Potomac River, USA
07 · Anwendungen, Stammentwicklung & Sicherheit
Anwendungen, Stammentwicklung & Sicherheit
Wo der Organismus bereits eingesetzt wurde, wie gut er sich gentechnisch verändern lässt und welche Handhabung er erfordert.
Anwendungen (3)
- Bioremediation organicsTRL 5/9
- Bioremediation metalsTRL 5/9
- Bioelectricity generationTRL 4/9
Stammentwicklung
Reaktorkompatibilität
- MFC dual chamber
- Smfc soil
- Sediment MFC
Genetik
- Genetisch zugänglich: ja
qPCR-Zielgene
- pilA
- ppcA
Biologische Sicherheit
- Pathogen: nein
Modellierungsressourcen
Verknüpftes GEM: iAF987.metallireducens
08 · Quellen & Datenqualität
Quellen & Datenqualität
Jeder Wert oben lässt sich auf eine Quelle zurückführen. So vollständig und so belastbar ist der Datensatz.
Qualität des Datensatzes
Literaturstand 2026-04-26 · Schema v1.2.0 · aktualisiert 2026-04-28 · importiert 2026-04-28
Offene Datenlücken (2)
- electrochemical_performance.max_current_density (audit: REQUIRED-missing for electrogen class)
- electrochemical_performance.max_power_density (audit: REQUIRED-missing for electrogen class)
Referenzen (2)
- Lovley DR, et al. (1993). Geobacter metallireducens gen. nov. sp. nov. Arch Microbiol 159:336-344.
- Holmes DE, et al. (2017). Metatranscriptomic evidence for DIET between Geobacter and Methanothrix in rice paddy soils. Appl Environ Microbiol 83:e00223-17.doi:10.1128/AEM.00223-17
Versionsverlauf
- 2026-04-27 · v1.2.0 · messai_curation
- Added genome_metadata, isolation provenance, type-strain confirmation.
- Added DIET conductive_mineral_mediation evidence (magnetite, Liu 2015).
- Did NOT promote partial → comprehensive: audit flags required electrochemical_performance fields as missing. Promotion deferred until citation-supported values are added.